记中科院上海巴斯德研究所疫情防控科技攻关

发布:2020-02-13 22:19:55  来源:ynzb.cn   作者:云南招生网


疫情中的科研突击队——记中科院上海巴斯德研究所疫情防控科技攻关

2020-02-13 中国科学报 倪思洁

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记中科院上海巴斯德研究所疫情防控科技攻关

中科院上海巴斯德研究所科技攻关组科研人员正在开展工作。中科院上海巴斯德研究所供图

  1月27日,大年初三,中国科学院上海巴斯德研究所(以下简称上海巴斯德所)党员、研究员郝沛走进所里。单位保安给她测好体温后,他们互道了声“新年好”。在新型冠状病毒疫情蔓延的新年里,这是郝沛经历的第一个面对面的拜年。

  之后,她走进研究所大楼,和上海巴斯德所科研骨干一起,在科技攻关《请战书》上,签上了自己的名字。

  《请战书》里这样写道:“我们愿为战胜新型冠状病毒疫情随时听候调遣,我们全体队员都义无反顾!”

  疫情里的科技之声

  郝沛等科研人员对新出现的病毒产生警觉,是在1月12日的下午。就在此前,我国研究人员在国外数据库公布了新型冠状病毒基因组序列。从1月11日下午开始,郝沛和研究团队的科研人员们一起,开始对数据进行生物信息学分析。熬了整整一个通宵后,他们终于在1月12日的下午看到了数据结果。

  “通过对武汉的新型冠状病毒spike蛋白的结构模拟计算,预测新型冠状病毒spike蛋白可以与人ACE2蛋白结合,可能通过该机制感染人体上呼吸道表皮细胞。”郝沛拿着数据结果与冠状病毒领域的大专家商量。

  大家一致认为,他们手中的分析数据可以为其他科研人员提供学术参考,也可以为科研人员了解此次病毒的起源、原生宿主,以及评估病毒在物种间或人类之间公共传播的风险提供帮助。于是,他们及时将数据共享了出去。

  随着病毒感染样本二代测序数据大量产出,郝沛等人开始考虑是否可以将自己的未知病毒分析流程共享,以便更便捷、系统地了解病毒情况。于是,他们与中国科学院上海营养与健康研究所合作,建立起病毒基因组自动化鉴定云平台(VIC)。

  “我们希望能够用擅长的生物信息学技术,协助医院机构很快作出专业判断。”郝沛说。

  这一平台可以直接对接人体样本的RNA二代测序原始数据,具有对数据全自动质量控制、拼接和病毒组成分析等功能,能够用来全面分析患者的呼吸道病毒组,研究其致病因子,助力临床诊断,为采用相应的治疗措施提供参考,同时还可以监测病毒变异趋势,以便提前部署应对措施。

  与时间和疫情赛跑

  因为疫情形势严峻,郝沛没有让她研究团队里的科研人员到所里上班。“上下班往返的路上会有感染的风险,我们做生物信息数据分析,是可以在家里办公的。”郝沛说。可是,她自己却从大年初三开始,每天到研究所工作,随时准备为研究团队做各种协调工作。

  从春节前至今,无论是做数据分析,还是建立“病毒基因组自动化鉴定云平台”,他们的工作一直没有停过。因为他们知道,疫情不会等人。

  和郝沛研究团队一样,整个上海巴斯德所都在与疫情和时间赛跑,因为这是嵌在这个研究所骨子里的使命。

  2003年非典疫情之后,中科院党组开始着手组织能够对抗传染病的科研力量,酝酿成立专门的研究所。

  从诞生之日起,这个研究所就担负起了抗疫的使命——聚焦病原微生物基本生命活动规律、重大传染性疾病的致病机制等关键科学问题,为公共卫生与生物安全提供科技支撑和解决方案。十多年来,上海巴斯德所随时准备在国家和人民需要的时候,冲上疫情防控和科技攻关的第一线。

  做科技攻关排头兵

  “同志们,这是一场没有硝烟的战斗,考验着每位党员的责任和担当。”1月31日,上海巴斯德所党委在《致全体党员书》中号召每位党员和干部做好科技攻关的排头兵、疫情防控的带头人、疫情防控的宣传员。

  在这场战斗中,上海巴斯德所反应迅速。疫情发生以来,所党委第一时间深入学习习近平总书记重要指示精神和中央、中科院党组关于疫情防控和科技攻关工作的决策部署。1月23日,研究所成立党政主要领导牵头的疫情应对总体领导小组和党委成员分别牵头的科技攻关组、应急工作组、科普和宣传组、供应保障组。1月31日,所党委对疫情防控工作进行了专题再研究、再部署、再动员,迅速协调制定了全面的疫情防控和科技攻关方案。

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